Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RhoP15409 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RhoP15409 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RhoP15409 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RhoP15409 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RhoP15409 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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