Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms