Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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Ccl20O89093 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccl20O89093 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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