Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Casq2O09161 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms