Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm20939L7N243 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Gm20939L7N243 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm20939L7N243 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm20939L7N243 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Gm20939L7N243 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm20939L7N243 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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