Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms