Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vmn1r67G5E8C1 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms