Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Ggta1-201ENSMUST00000044255 1221 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp32F8VPZ3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms