Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gm13872-202ENSMUST00000143995 1408 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Gm3250E9Q1M3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm6591-201ENSMUST00000121063 434 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm28147-201ENSMUST00000187133 621 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm29478-201ENSMUST00000191272 688 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 AC123738.1-201ENSMUST00000224796 773 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 AC140451.1-201ENSMUST00000227984 737 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Defb4-201ENSMUST00000081017 454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms