Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myo5cE9Q1F5 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms