Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm39147-202ENSMUST00000211730 882 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Supt4a-201ENSMUST00000093955 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Zfp419-201ENSMUST00000173446 916 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm8960-201ENSMUST00000219787 788 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm9869-201ENSMUST00000063858 375 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fndc1E9Q043 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms