Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Srp54bE9PXC0 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms