Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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Rnf217D3YYI7 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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Rnf217D3YYI7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rnf217D3YYI7 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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