Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rrn3B2RS91 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms