Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Ckap5A2AGT5 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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