Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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