Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm17190V9GX38 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm17190V9GX38 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 273.6 ms