Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Mrpl40Q9Z2Q5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Mrpl40Q9Z2Q5 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Mrpl40Q9Z2Q5 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Mrpl40Q9Z2Q5 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Mrpl40Q9Z2Q5 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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