Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ubl3Q9Z2M6 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms