Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rnf4Q9QZS2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Rnf4Q9QZS2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnf4Q9QZS2 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnf4Q9QZS2 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnf4Q9QZS2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnf4Q9QZS2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnf4Q9QZS2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnf4Q9QZS2 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Rnf4Q9QZS2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rnf4Q9QZS2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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