Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Nphp1Q9QY53 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms