Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Trim39Q9ESN2 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Trim39Q9ESN2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Trim39Q9ESN2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Trim39Q9ESN2 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Trim39Q9ESN2 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Trim39Q9ESN2 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Trim39Q9ESN2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Trim39Q9ESN2 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Trim39Q9ESN2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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