Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ropn1Q9ESG2 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms