Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clstn2Q9ER65 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms