Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Hmg20aQ9DC33 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms