Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Smg9Q9DB90 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Smg9Q9DB90 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Smg9Q9DB90 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
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Smg9Q9DB90 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Smg9Q9DB90 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Smg9Q9DB90 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Smg9Q9DB90 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Smg9Q9DB90 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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