Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Subh2bvQ9D9Z7 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Subh2bvQ9D9Z7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Subh2bvQ9D9Z7 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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