Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Lonrf3Q9D4H7 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Lonrf3Q9D4H7 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Lonrf3Q9D4H7 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Lonrf3Q9D4H7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Lonrf3Q9D4H7 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Lonrf3Q9D4H7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Lonrf3Q9D4H7 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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