Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trim42Q9D2H5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms