Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Trappc6bQ9D289 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Trappc6bQ9D289 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Trappc6bQ9D289 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Trappc6bQ9D289 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Trappc6bQ9D289 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Trappc6bQ9D289 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Trappc6bQ9D289 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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