Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms