Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
Ciao1Q99KN2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ciao1Q99KN2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms