Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Apobec3Q99J72 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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