Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LgsnQ8CIX8 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LgsnQ8CIX8 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms