Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Pramef8Q8CE24 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms