Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CntrobQ8CB62 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CntrobQ8CB62 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms