Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Gm13002-201ENSMUST00000119286 682 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Amigo3Q8C2S7 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Amigo3Q8C2S7 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Amigo3Q8C2S7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Amigo3Q8C2S7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Amigo3Q8C2S7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Amigo3Q8C2S7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Amigo3Q8C2S7 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Amigo3Q8C2S7 AY761184-201ENSMUST00000071886 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Amigo3Q8C2S7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Amigo3Q8C2S7 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Amigo3Q8C2S7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Amigo3Q8C2S7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm6946-201ENSMUST00000182237 987 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Amigo3Q8C2S7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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