Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Atg16l1Q8C0J2 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Atg16l1Q8C0J2 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Atg16l1Q8C0J2 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Atg16l1Q8C0J2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Atg16l1Q8C0J2 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Atg16l1Q8C0J2 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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