Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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FarsaQ8C0C7 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
FarsaQ8C0C7 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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