Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc18Q640L5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm15746-201ENSMUST00000120684 1027 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc18Q640L5 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms