Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Defa17Q64016 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms