Protein–RNA interactions for Protein: Q61501

E2f1, Transcription factor E2F1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f1Q61501 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
E2f1Q61501 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms