Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
DbpQ60925 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms