Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
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Trappc1Q5NCF2 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
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Trappc1Q5NCF2 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
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Trappc1Q5NCF2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
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Trappc1Q5NCF2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
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Trappc1Q5NCF2 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Rps6kc1-201ENSMUST00000061611 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
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Trappc1Q5NCF2 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Trappc1Q5NCF2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
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Trappc1Q5NCF2 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
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