Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Gm28047Q3US59 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm28047Q3US59 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms