Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms