Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem253Q3UNB8 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms