Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gtpbp6Q3U6U5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gtpbp6Q3U6U5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gtpbp6Q3U6U5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gtpbp6Q3U6U5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gtpbp6Q3U6U5 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gtpbp6Q3U6U5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Gtpbp6Q3U6U5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gtpbp6Q3U6U5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Gtpbp6Q3U6U5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms