Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Kdm4dQ3U2K5 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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Kdm4dQ3U2K5 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Kdm4dQ3U2K5 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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Kdm4dQ3U2K5 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Kdm4dQ3U2K5 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
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Kdm4dQ3U2K5 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Kdm4dQ3U2K5 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Kdm4dQ3U2K5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Kdm4dQ3U2K5 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Kdm4dQ3U2K5 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Kdm4dQ3U2K5 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Kdm4dQ3U2K5 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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