Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Trappc9Q3U0M1 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms